O INCT ETEs Sustentáveis é formado por 7 (sete) das mais importantes instituições de ensino e pesquisa na área de saneamento básico no Brasil, a saber: UFMG (líder), UFC, UFMS, UFPE, UFRJ, USP e ISAE/FGV.
Cabe à UFMG a coordenação e a subcoordenação geral do INCT, com a liderança na condução de todas as tarefas necessárias à perfeita gestão administrativa, financeira e técnico-científica do projeto. A fim de se garantir o trabalho em rede e o compartilhamento de responsabilidades, o projeto conta com grande envolvimento de todas as seis instituições parceiras, as quais contribuem no desenvolvimento das seguintes atividades principais:
- Auxílio na gestão geral do projeto, via participação direta no Comitê Gestor (CG);
- Coordenação de pelo menos um dos nove Comitês Técnico-Científicos (CTC);
- Condução dos seus próprios projetos de pesquisa específicos.
A figura a seguir mostra a estrutura organizacional e funcional do INCT ETEs Sustentáveis.