O projeto piloto “Monitoramento Covid Esgotos”, coordenado pelo INCT ETEs Sustentáveis e pela ANA (Agência Nacional de Águas e Saneamento Básico) em parceria com a Copasa (Companhia de Saneamento de Minas Gerais), IGAM (Instituto Mineiro de Gestão das Águas) e SES-MG (Secretaria Estadual de Saúde de Minas Gerais) foi compreendido no período de 13 de abril de 2020 até 26 de março de 2021 realizado em Belo Horizonte e parte de Contagem, e propiciou grandes aprendizados para o monitoramento do esgoto como uma ferramenta epidemiológica, em particular para o combate à COVID-19.  O projeto piloto deu frutos a um novo projeto, a Rede de Monitoramento Covid Esgotos, também coordenado pelo INCT ETEs Sustentáveis e pela ANA, que conta com o monitoramento de 6 capitais brasileiras.